Effizientes Primer-Design mit PerlPrimer
PerlPrimer ist eine kostenlose und quelloffene GUI-Anwendung, die speziell für das Design von Primern für verschiedene PCR-Methoden entwickelt wurde. Die Software bietet eine benutzerfreundliche Oberfläche und automatisiert den Prozess der Primer-Design, sodass Forscher effizient arbeiten können. Zu den Hauptfunktionen gehören die Berechnung möglicher Primer-Dimere, die Möglichkeit, genomische oder cDNA-Sequenzen von Ensembl abzurufen, sowie die Durchführung von BLAST-Suchen über NCBI oder lokale Server.
Die Anwendung unterstützt auch die Erkennung von ORFs und CpG-Inseln und ermöglicht das Hinzufügen von Klonierungssequenzen zu Primern, die automatisch in den richtigen Leserahmen angepasst werden. PerlPrimer berechnet präzise die Schmelztemperatur der Primer unter Berücksichtigung der Salzbedingungen der PCR, was zu einer maximalen Produktausbeute führt. Die Software ist plattformübergreifend und wurde erfolgreich unter Windows, GNU/Linux und Mac OS X getestet.
